A Indústria Aeronáutica Neiva foi fundada no Rio de Janeiro em 1954 por José Carlos de Barros Neiva, produzindo planadores, e mudou-se para Botucatu em 1956.
Em 1975 inicia a produção de aviões leves para a Embraer.
Em 1980 a Neiva é adquirida pela Embraer.
Em 1982, inicia a produção do Avião Agrícola Ipanema.
Em 2005, certifica a primeira e única aeronave no mundo movida a etanol e passa a produzir a versão do Ipanema movido com esse tipo de combustível (EMB 202A);
Em 2006, tornou-se Unidade Embraer;
De 2007 a 2009, passou por uma ampliação e hoje a Unidade possui cerca de 90.000 metros quadrados e aproximadamente 1.800 empregados;
Atualmente a Unidade Botucatu é responsável pela produção do Ipanema, fabricação de peças e estruturas para jatos das famílias ERJ 145, EMBRAER 170/190 e Phenom, montagem da fuselagem e subconjuntos do Super Tucano e fabricação de peças de reposição para aviões da Embraer com produção descontinuada, como o Brasília, Minuano, EMB-810D, Planador BN-1, PlanadorBN-2, Paulistinha, Regente, Universal T-25, Sertanejo, Corisco, Carajá.
